始建于1955 年的中国中医科学院中药研究所，是我国成立最早的一所国家级研究中药的专门机构。自1983 年起被确认为世界卫生组织传统医学合作中心。全所现有职工400 余人，设有中药理论与本草文献研究中心、生药研究中心、中药质量标准研究中心、中药制剂研究中心、中药炮制研究中心、中药药代动力学研究中心、中药药理研究中心、生物力药理学研究中心、中药安全评价中心(GLP)、中药注射剂安全性研究中心、中药新药研发中心、中药生物技术研究中心、青蒿素研究中心、中药数据中心、整合中药学研究中心和中药质量控制技术国家工程实验室。拥有4 个国家中医药管理局重点学科，5 个国家中医药管理局三级中医药科研实验室，1个北京市重点实验室。主办国家级学术期刊《中国中药杂志》、《中国实验方剂学杂志》及科普期刊《家庭中医药》。设有中药学、中西医结合基础硕士研究生、博士研究生培养点及中西医结合基础、中药学博士后流动站。
中药研究所是中药理论、中药产业关键技术、中药创新药物关键技术完善的中药基础和应用基础研究、中药新药研发的技术平台。目前承担国家自然科学基金重点课题、国家十二五科技支撑计划课题、国家重大基础性研究计划( 973 项目)、国家高技术研究发展计划(863 计划)、国家重大新药创制、名老中医学术传承课题等 251 项，已获科研成果奖261 项，其中国家级奖19 项;开发新药32 个, 出版中医药著作196 部;发表论文4620 篇。
近年来，中药研究所在高水平论文发表、成果获奖、项目经费、新药研发、企业服务、人才引进、国际合作、环境设备升级等方面均取得了长足的发展。近三年，在国际知名杂志 Sci Rep，Biotech. Adv.，PNAS，Bio Rev., Chemical comm., International Journal ofCancer， British Journal of Pharmacology 等发表SCI 论文301 篇。一批高水平科研成果获奖，其中包括国家科技进步一等奖、中华中医药学会科学技术一等奖、李时珍医药创新奖、中国中西医结合学会科学技术一等奖、高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)科技进步奖一等奖等，获奖成果水平明显提升。纵向课题经费创历史新高，承担国家各类重大科研项目数量稳步增长。
该所屠呦呦研究员由于在青蒿素研究中的杰出贡献，2011 年被授予拉斯克临床医学研究奖，2015 年获得华伦•阿尔波特基金会奖和诺贝尔医学奖 。同时，这里还有一大批中医药方面的顶级专家和学者。近年来，又从美国、英国、德国、荷兰、日本等国际知名大学和研究机构引进一批具有海外研究背景的优秀人才，提高了人才队伍国际化水平，优化梯队结构。目前与世界卫生组织、美国、奥地利、挪威、日本、中国澳门和中国台湾等80 余个国家、地区和国际组织进行科技项目合作和人才交流。完成国际化标准实验室改造，优化科研环境，现拥有600 兆核磁共振，LC-MS 单四级杆质谱仪，TRAP-MS 离子阱质谱仪，高内涵细胞分子影像仪，基因分析仪等一批高性能科研仪器，为开展中药鉴定、制备工艺、生物技术、质量控制、药理毒理等专业研究提供精良的设备保障。现有图书馆藏4 万余册。
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